充分溶解并混勻PCR反應(yīng)所需的各種溶液。將2x 長片段PCR 擴增 預(yù)混液( long fragment PCR Master Mix)置于冰浴上或冰盒內(nèi)。參考下表在冰上設(shè)置PCR反應(yīng):
Component | 20uL RXN | 25uL RXN | 50uL RXN | Final Concentration |
2x 長片段PCR 擴增 預(yù)混液 | 10uL | 12.5uL | 25uL | 1 × |
10uM Forward Primer | 0.4uL | 0.5uL | 1.0uL | 0.2uM |
10uM Reverse Primer | 0.4uL | 0.5uL | 1.0uL | 0.2uM |
Template DNA | variable | variable | variable | variable |
Nuclease-Free Water | to 20uL | to 25uL | to 50uL |
|
2 . 不同模板最佳反應(yīng)濃度有所不同,反應(yīng)體系推薦模板使用量可參見下表。
Template DNA | 20uLRXN | 25uL RXN | 50uL RXN |
Genomic DNA | 4ng-0.4ug | 5ng-0.5ug | 10ng-1ug |
Plasmid or Vrial | 4pg-4ng | 5pg-5ng | 10pg-10ng |
cDNA | 4pg-0.4ug | 5pg-0.5ug | 10pg-1ug |
3. 用移液器輕輕吹打混勻或輕微Vortex混勻,室溫離心數(shù)秒,使液體積聚于管底。
反應(yīng)程序
1 .退火溫度應(yīng)根據(jù)引物Tm值進行調(diào)整(50-72℃)。
2. 延伸時間需根據(jù)擴增片段的長度和復(fù)雜性進行調(diào)整。
3. 各設(shè)置好的PCR反應(yīng)管置于PCR儀上,開始PCR反應(yīng)。
STEP | TEMP | TIME |
Initial Denaturation | 98°C | 30 sec |
25–35 Cycles | 98°C | 10 sec |
| 50–72 °C | 15 sec |
| 72°C | 15-30 sec/kb |
Final Extension | 72°C | 5 min |
Hold | 4–10 °C | ∞ |